- Sekretariat Daerah Kabupaten
- Sekretariat DPRD
- Inspektorat Daerah Kabupaten Simalungun
- Dinas Pendidikan
- Dinas Kesehatan
- Dinas Pekerjaan Umum, Perumahan dan Penataan Ruang
- Dinas Sosial
- Dinas Pemberdayaan Perempuan dan Perlindungan Anak
- Dinas Ketahanan Pangan, Perikanan dan Peternakan
- Dinas Lingkungan Hidup
- Dinas Kependudukan dan Pencatatan Sipil
- Dinas Pemberdayaan Masyarakat dan Pemerintahan Nagori
- Dinas Pengendalian Penduduk dan Keluarga Berencana
- Dinas Perhubungan
- Dinas Komunikasi dan Informatika
- Dinas Koperasi Usaha Kecil dan Menengah
- Dinas Penanaman Modal dan Pelayanan Perizinan Terpadu Satu Pintu
- Dinas Perpustakaan dan Kearsipan
- Dinas Pariwisata dan Kebudayaan
- Dinas Pertanian
- Dinas Pemuda dan Olahraga
- Dinas Perindustrian dan Perdagangan
- Satuan Polisi Pamong Praja
- Dinas Tenaga Kerja
- Badan Perencanaan Pembangunan Daerah
- Badan Kepegawaian, Pendidikan dan Pelatihan Daerah
- Badan Pengelolaan Keuangan dan Aset Daerah
- Badan Pendapatan Daerah
- Badan Penanggulangan Bencana Daerah
- Sekretariat Dewan Pengurus KORPRI
- Administrator Kawasan Ekonomi Khusus Sei Mangkei
- Badan Kesatuan Bangsa dan Politik
- Rumah Sakit Umum Daerah Perdagangan
